Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01822 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01822 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01822 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01822 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01822 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01822 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01822 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01822 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01822 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01822 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01822 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01822 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms