Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01820 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01820 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01820 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01820 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01820 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01820 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01820 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01820 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01820 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01820 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01820 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01820 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01820 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01820 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01820 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01820 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01820 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01820 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01820 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01820 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01820 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01820 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01820 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01820 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01820 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01820 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms