Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01803 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01803 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01803 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01803 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01803 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01803 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01803 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01803 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01803 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01803 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01803 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01803 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01803 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms