Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01797 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01797 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01797 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01797 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01797 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01797 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01797 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01797 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01797 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01797 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01797 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01797 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01797 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01797 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms