Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01792 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01792 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01792 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01792 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01792 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01792 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01792 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01792 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01792 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01792 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01792 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01792 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01792 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01792 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01792 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms