Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01724 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01724 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01724 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01724 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01724 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01724 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01724 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01724 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01724 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01724 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01724 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01724 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01724 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01724 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01724 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms