Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01667 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01667 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01667 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01667 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01667 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01667 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01667 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01667 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01667 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01667 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01667 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01667 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01667 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01667 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01667 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01667 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01667 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01667 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01667 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01667 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01667 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms