Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1O88643 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1O88643 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1O88643 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms