Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vti1bO88384 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vti1bO88384 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vti1bO88384 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms