Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms