Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly86O88188 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms