Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stra6O70491 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stra6O70491 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stra6O70491 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra6O70491 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra6O70491 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stra6O70491 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra6O70491 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms