Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms