Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alx3O70137 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alx3O70137 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alx3O70137 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alx3O70137 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alx3O70137 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alx3O70137 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alx3O70137 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alx3O70137 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms