Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtogO55225 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtogO55225 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtogO55225 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtogO55225 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtogO55225 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtogO55225 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtogO55225 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtogO55225 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtogO55225 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtogO55225 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtogO55225 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtogO55225 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OtogO55225 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtogO55225 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtogO55225 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtogO55225 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtogO55225 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtogO55225 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtogO55225 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtogO55225 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtogO55225 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtogO55225 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtogO55225 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtogO55225 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtogO55225 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms