Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms