Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms