Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mmp10O55123 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp10O55123 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms