Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3O55013 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3O55013 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3O55013 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3O55013 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3O55013 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3O55013 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3O55013 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3O55013 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3O55013 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3O55013 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3O55013 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3O55013 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3O55013 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3O55013 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3O55013 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms