Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms