Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd200O54901 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms