Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb3O54890 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms