Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxO54751 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CrxO54751 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CrxO54751 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CrxO54751 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxO54751 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxO54751 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxO54751 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CrxO54751 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CrxO54751 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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