Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FxnO35943 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FxnO35943 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FxnO35943 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FxnO35943 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FxnO35943 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FxnO35943 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FxnO35943 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FxnO35943 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FxnO35943 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FxnO35943 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FxnO35943 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FxnO35943 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FxnO35943 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms