Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf18O35714 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf18O35714 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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