Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PnnO35691 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PnnO35691 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PnnO35691 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PnnO35691 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PnnO35691 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnnO35691 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnnO35691 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnnO35691 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnnO35691 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PnnO35691 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnnO35691 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnnO35691 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnnO35691 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnnO35691 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnnO35691 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PnnO35691 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnnO35691 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnnO35691 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnnO35691 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnnO35691 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnnO35691 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PnnO35691 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PnnO35691 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnnO35691 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnnO35691 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnnO35691 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnnO35691 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PnnO35691 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PnnO35691 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PnnO35691 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PnnO35691 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PnnO35691 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PnnO35691 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PnnO35691 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnnO35691 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnnO35691 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnnO35691 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnnO35691 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnnO35691 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PnnO35691 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PnnO35691 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PnnO35691 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PnnO35691 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PnnO35691 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PnnO35691 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PnnO35691 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PnnO35691 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PnnO35691 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PnnO35691 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PnnO35691 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PnnO35691 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms