Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppef2O35385 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppef2O35385 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppef2O35385 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms