Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Abcc1O35379 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Abcc1O35379 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Abcc1O35379 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms