Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KeraO35367 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KeraO35367 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KeraO35367 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KeraO35367 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KeraO35367 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KeraO35367 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KeraO35367 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KeraO35367 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KeraO35367 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KeraO35367 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KeraO35367 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KeraO35367 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KeraO35367 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KeraO35367 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KeraO35367 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KeraO35367 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KeraO35367 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KeraO35367 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KeraO35367 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KeraO35367 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KeraO35367 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KeraO35367 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KeraO35367 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KeraO35367 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KeraO35367 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KeraO35367 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KeraO35367 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KeraO35367 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KeraO35367 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KeraO35367 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KeraO35367 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KeraO35367 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KeraO35367 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KeraO35367 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KeraO35367 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KeraO35367 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KeraO35367 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KeraO35367 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms