Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pkd2O35245 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pkd2O35245 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms