Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms