Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap23O09044 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap23O09044 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap23O09044 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap23O09044 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap23O09044 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms