Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra2O08842 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfra2O08842 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms