Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfil3O08750 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms