Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MttpO08601 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MttpO08601 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MttpO08601 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MttpO08601 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MttpO08601 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MttpO08601 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MttpO08601 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MttpO08601 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MttpO08601 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MttpO08601 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MttpO08601 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MttpO08601 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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