Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sec22bO08547 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec22bO08547 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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