Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna5O08543 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna5O08543 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna5O08543 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna5O08543 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms