Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm6871L7N248 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm6871L7N248 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm6871L7N248 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm6871L7N248 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm6871L7N248 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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