Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zfp955bL7N232 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp955bL7N232 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms