Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vwa3bJ9JI28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vwa3bJ9JI28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms