Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm2035J3QP87 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms