Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm20918J3QN17 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20918J3QN17 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20918J3QN17 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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