Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3415J3QMS8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3415J3QMS8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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