Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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