Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AK157302I3ITR1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms