Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms