Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b1G5E829 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms