Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfgef1G3X9K3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfgef1G3X9K3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms