Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zkscan2G3X952 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zkscan2G3X952 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zkscan2G3X952 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms