Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubap1lG3UW59 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubap1lG3UW59 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms